沼气工程利用的原理是通过将有机废弃物（如粪便、厨余垃圾等）放入沼气池中，利用沼气菌的发酵作用，将有机物质分解成沼气和沼渣。沼气主要由甲烷和二氧化碳组成，可以作为燃料用于烹饪、取暖、发电等方面。沼渣则可以作为有机肥料，用于农田种植。这种利用方式既能够减少有机废弃物的污染，又能够提供清洁能源和有机肥料，具有环保、经济、社会效益。