机关幼儿园和普通公立幼儿园的区别主要在以下几个方面：
归属不同：机关幼儿园是由政府机关或事业单位创办的，属于机关幼儿园系统；普通公立幼儿园则是由地方政府创办的，属于公立幼儿园系统。
招生对象不同：机关幼儿园主要面向政府机关和事业单位的职工子女招生，而普通公立幼儿园则面向社会公众招生。
教育质量不同：由于机关幼儿园的招生对象相对固定，教育资源相对集中，因此在教育质量上可能会更高一些。而普通公立幼儿园则面向社会公众，教育资源相对分散，教育质量可能会有所差异。
政策待遇不同：机关幼儿园的教职工享有政府机关和事业单位的待遇，包括工资、福利等方面的优惠；而普通公立幼儿园的教职工则按照地方政府的规定享受待遇。
学费不同：机关幼儿园的学费相对较低，而普通公立幼儿园的学费则按照地方政府的规定收取。