对彗星进行深度撞击的主要目的是为了研究彗星的内部结构和成分。通过撞击，可以探测彗星内部的物质组成、密度、温度等信息，从而更好地了解彗星的形成和演化过程。此外，对彗星进行深度撞击还可以模拟太阳系形成时期的碰撞过程，帮助我们更好地理解太阳系的演化历史。