化石不仅仅是石化的动物骨骼，还包括植物、微生物、化石燃料等。化石是指在地质历史中形成的保存下来的生物遗骸、遗体或遗迹，经过长时间的压力、渗透、沉淀、矿化等作用，形成的石头状或煤炭状的化石。因此，化石不仅包括动物骨骼，还包括植物的叶子、树干、果实等，以及微生物的化石。