南京有雨花石是因为其地质构造和地质历史。南京位于长江中下游平原，地下水资源丰富，同时地处岩溶地区，地下水与石灰岩反应形成了雨花石。此外，南京地区的地质历史也对雨花石的形成起到了重要作用。在地质演化过程中，南京地区曾经历过多次地壳运动和海侵退，这些地质变化为雨花石的形成提供了条件。